La définition scientifique d'un prébiotique est «un substrat qui est utilisé de manière sélective par des micro-organismes hôtes conférant un avantage pour la santé». Les prébiotiques sont le plus souvent des fibres solubles. Néanmoins toutes les fibres solubles ne sont pas des prébiotiques. En effet les fibres prébiotiques sont celles qui ne peuvent pas être digérées, servant de nourriture à la bonne flore intestinale.